《易经》的思维是整体思维，这既是它的优点也是他的缺点。
《易经》的直观图象是卦和爻。《易经》的卦是复卦,它就是一个小系统,又分上下卦,每卦由三爻组成,它的寓意就是人物事不是独立存在的,至少有上和下两个层次相联系。首先是把所分析的人物事放进一个大的系统中,然后在纵向维度把这个大系统进行层次的定位,看看它们处在什么层次上,再对它的上一层次的对象和下一层次的对象进行分析和了解,对分析的人物事取得大体的了解和总体的定位。在对它们自身进行直接研究时,也同步关注上一层和下一层同类事物在发生什么变化,对它们会产生什么间接影响。
在由下到上的纵向递进层次来看,对人类社会的研究有以下层次:(1)个人;(2)家庭(家族、生活工作关系密切人员);(3)生活区域(村、镇、社区);(4)所在区域(县、市、省);(5)所在国家;(6)所在大区(七大洲);(7)世界和国际社会。个人是人类社会研究的最低层次或最基本单位,国际社会是研究人类社会的最高层次。
如果是对个人进行研究,那么它的层次可能会有:(1)细胞。(2)细胞可分为三部分:细胞膜、细胞质和细胞核(蛋白质—脂类—糖类,水—蛋白质—核糖核酸—酶—电解质,染色质—核酸)。(3)八大系统(消化系统,神经系统,运动系统,内分泌系统,泌尿系统,生殖系统,循环系统,呼吸系统,感觉器官)。(4)人体。(5)家庭—家族。
易经视研究问题的大小分成不同层次,最高层次是宇宙。其次是天地自然一人类社会。第三层次是天地自然的下一层次——在自然界是有机物（动物、植物、微生物)—无机物;在人类社会则是各个领域(政治,经济、文化、军事、宗教、社会、艺术、教育等),各区域(东亚、欧洲、非洲、拉美、北美、大洋洲),各阶段(原始社会—古代—近代—现代—当代)等。中间会有无数层次，最后一个最小层次和分析单位才是一个特别具体的问题,如自然界研究中的中子,粒子、光子,质子,量子,人类研究中的人的神经,细胞、DNA 等,在易经思维中最小的单位是爻。
整体层次方法要求人们研究任何一个问题(除最高层级的宇宙没有上一层级和最低层次的质子没有下一层次外),都要把问题放进一个至少上一层级的系统中去研究,也要至少放到下一层级的系统中进行研究。当然,这种整休思维也不是说任何事情和在任何时候都必须把所有的东西都研究之后才能着手对具体问题的研究,否则就没有人能从事任何研究。易经思维的整体研究,是有条件的,有针对性的,有取舍的,有重点的。但是如果一开始就拒绝从整体入手,只限于对某个问题的直接研究,可能在某个阶段会有较大的收获和进展,但终会有较大的局限性、片面性、狭隘性。
《易经》是整体思维，比分析思维全面，这是它的优点，但毕竟不如先进的哲学思维精细深刻，这是他的缺点。
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