哈尔滨医科大学附属第二医院（The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University）创建于1954年，是综合性三级甲等医院。2017年11月，获第五届全国文明单位荣誉。
医院占地面积50万平方米，建筑面积51万平方米，拥有1个门诊部、10个住院部及4所“院中院”—— 风湿病医院、心血管病医院、五官医院、糖尿病医院。全院职工4483人，其中卫生技术人员3907名，正、副高职814人，博士生导师70人，硕士生导师346人,享受国务院特殊津贴21人，“龙江学者”6人、“国家杰出青年基金”获得者1人、“教育部新世纪优秀人才”1人；开放床位4500张，年出院病人16万余人次，年手术例数8万余人次，年门诊量超过150万人次。医院设有44个临床科室、13个医技科室、96个病房；拥有国家新药临床实验研究中心、国家药品临床研究机构、省部共建教育部心肌缺血和诊疗技术重点实验室、黑龙江省器官移植中心、产前诊断与遗传病诊断中心、血液净化中心、风湿病研究所、心血管外科研究所、黑龙江省麻醉与危重病学重点实验室、黑龙江省高校药物研究重点实验室、麻醉基础理论与应用重点实验室。医院拥有伽玛刀、X刀、3.0TMRI、256排螺旋CT、2.0DSA、ECT、双版DR、蔡司手术显微系统、直线加速器等先进医疗设备。
医院坚持开展高、精、尖医疗新技术，成功地完成心脏移植、肺移植、肝脏移植、脾脏移植、肾脏移植、睾丸移植、心肺联合移植、胰肾联合移植、甲状腺-甲状旁腺-胸腺联合移植、角膜移植、骨髓移植等移植工作，使我院在器官移植种类、技术和质量等方面都居国内领先地位。“换心人” 于文峰术后现已存活20年，创造了心脏移植术后生命质量最好、生存时间最长的亚洲记录。心脏移植课题组在2002年荣获国家科技进步二等奖。肝脏移植病人也已健康存活17年。2006年成功完成全主动脉置换手术，成为国内能够开展此项技术的两家医院之一。医院以“病员至上，细心医护”为院训，重视医德医风建设，开展“以病人为中心”的整体护理工作，满足、方便了不同层次患者的医疗、保健、康复需求。2001年4月，哈尔滨医科大学护理学院在我院成立，同年5月，我院护理部李秋洁主任荣获“第38届国际南丁格尔奖”。获卫生部“2010年优质护理服务考核优秀医院”。
作为哈尔滨医科大学第二临床医学院，拥有一级学科博士点3个、二级学科博士点21个，三级学科博士、硕士点33个。临床医学博士后科研流动站和临床药学博士后科研工作站各1个, 卫生部专科医师培训专业基地31个。国家重点(培育)学科1个，省重点学科14个,省领军人才梯队8个，省特聘教授岗位学科8个，卫生部内镜专业技术培训基地4个，卫生部心血管介入技术培训基地3个，是卫生部临床药师培训基地。国家级特色专业2个，省重点专业3个，国家级精品课程4门、精品资源共享课2门、省级精品课程5门、省教学名师1人，获国家级教学成果奖1项。承担普通教育(五年制、七年制、留学生)、研究生教育(博士、硕士)、成人和继续教育等多轨道教学任务。医院拥有5200平米独立教学大楼、3500平米“国家级实验教学示范中心”、2.2万平米“全科医生临床培养基地”、1.4万平米本科生公寓和1.6万平米研究生公寓。“十一?五”以来主(副主)编卫生部规划教材、视听教材、CAI课件共38部；发表国家级教学论文103篇；获批省级以上教学课题144项；获得省级以上教学成果115项。
哈尔滨医科大学附属第二医院现任领导：
焦军东
焦军东，男，汉族，1968年9月出生，中共党员，博士研究生学历，1991年7月参加工作，现任哈医大二院党委副书记、院长，主任医师。
王永晨 党委书记
王永晨，男，现为哈尔滨医科大学附属第二医院主任医师、教授。
2020年2月19日，入选国家健康科普专家库第一批成员名单。
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